Сорок дней спустя
Идет второй месяц после начала глобальной атомной войны, спровоцированной попыткой США и НАТО уничтожить российский ядерный арсенал внезапным нападением. Обмен ядерными ударами между ними спровоцировал во всем мире цепную реакцию крупномасштабных войн с применением оружия массового поражения — между Израилем и арабским миром, Индией и Пакистаном, Китаем и Японией. А также множество локальных войн на всех континентах за еду, чистую воду и оставшиеся материальные ресурсы. В Убежище новосибирского Академгородка продолжают бороться за жизнь несколько тысяч человек во главе с отставным майором Демьяновым. Чтобы обеспечить укрываемых всем необходимым, приходится совершать опасные вылазки во внешний мир. Понимая ограниченность их запасов, майор делает все, чтобы скрыть местонахождение убежища. Он принимает только немногих людей с поверхности. Одна из таких — преподаватель Анастасия Заречина, рассказавшая о страшной судьбе людей в новосибирском метрополитене. На поверхности укрывшиеся в убежище держат только наблюдательный пункт. Они — практически единственные живые люди во всем районе Новосибирска после исхода из него уцелевших в сельскую местность. В один из дней дежурящие на наблюдательном пункте бойцы видят сигнальную ракету. С убежищем связывается небольшая группа вооруженных незнакомцев.
Как оказалось, на юге области в пятидесяти километрах от Новосибирска борется за выживание маленькая община, поселившаяся в бывшем санатории. Эти люди — сурвайверы (выживальщики), задолго до войны верившие, что нападение со стороны Запада и крах цивилизации неизбежны. Это не секта, а группа товарищей-единомышленников, объединенных общими взглядами. Они поклонники «сильной руки», националисты и имперцы. На стене у них — портрет Сталина. Нынешнюю власть они считают недостаточно авторитарной, а потому слабой. Их лидер Владимир Богданов — человек разносторонний. В прошлом он служил в ВДВ, получил образование как историк, а сейчас является мелким предпринимателем. Именно он арендует здание бывшего санатория в лесистой местности вдали от города, чтоб оборудовать там «гнездо», где можно пересидеть опасный период, с тем, чтобы потом начать партизанскую борьбу. Также сурвайверы заранее обзаводятся охотничьим оружием и запасом продуктов. Но по мере того, как идут годы, а конец света все не наступает, «сборы» в санатории превращаются в посиделки старых друзей с семьями. Однако в этом году все неожиданно происходит в соответствии с их прогнозами. Переждав первые дни ядерных ударов и паники, видя, что катаклизм скорее всего имеет глобальный характер, «выживальщики» решают раздобыть продуктов на ближайшие годы, и идут ради этого на применение насилия. В ближайшем поселке Черепаново они совершают налет на продуктовый склад, принадлежащий крупной компании «Сибагропром». Вынужденная перестрелка с нарядом полиции (который, возможно, хотел добраться до склада сам) заставляет их пролить первую кровь. Раздобыв кроме продуктов еще и медикаменты, и топливо, они решают отсидеться на своей базе. Прослушивая эфир своей радиостанцией, они натыкаются на переговоры людей из убежища, вскоре решают вступить с ними в контакт, что и делают примерно через два месяца. Две общины объединяются и решают выживать вместе, Богданов становится ближайшим помощником майора Демьянова.
В это время Александр Данилов скитается по развалинам своего родного города Прокопьевска. Почти весь район, где он проживал, занимает гигантская воронка, образовавшаяся из-за проседания земных пород, подработанных горными выработками, вследствие наземных ядерных ударов. Александр не находит ни своей семьи, ни тех, кого знал. Зато его находят несколько агрессивных людей, которых ему пришлось убить или покалечить, чтоб отстоять свою жизнь. Всего один человек не пытается причинить ему вреда — одинокий старик, на избушку которого он наткнулся. Это бывший шахтер-проходчик, устроивший себе до войны импровизированное убежище у себя в подполе. Пенсионер помогает Данилову встать на ноги после тяжелой лучевой болезни и истощения.
Однако, придя в себя, Александр решает идти дальше, узнав от старика о других уцелевших. Через полностью опустошенную часть города он движется к находящемуся в отдалении Рудничному району. Там он надеется найти кого-то из тех, кого знал. Но попадает в плен к группе вооруженных людей. Их возглавляет Сашин тезка — Александр Мищенко — городской сумасшедший, трамвайный мудрец, который раньше эпатировал горожан рифмованными частушками («Если лидер либераст, то он Родину продаст», «Если в кране нет воды, в чем причина той беды?»), а также матерными выражениями в адрес мэра и президента. Но для юродивого он физически крепок. Теперь его зовут Мясник, и он, «краповый берет», прошедший «горячие точки», живет с товарищами в здании кинотеатра, который был заброшен еще до войны, возле развалин торгового центра «Оптима», откапывая продукты и отбиваясь от наведывающихся сюда деревенских жителей. На время Александр Данилов становится пленником, а потом и собратом этих странных людей. Они вместе добывают пищу из развалин супермаркета и отгоняют чужаков. Но только до тех пор, пока их лагерь не уничтожает наведенная на тепло крылатая ракета. Где-то там, на неведомых театрах войны продолжается схватка сверхдержав или того, что от них осталось. Пользуясь случаем, деревенские нападают на обитателей руин торгового центра. Данилов и Мясник оказываются одними из немногих уцелевших и с боем прорываются из города, после чего расходятся в разные стороны.
